Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dkk4Q8VEJ3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dkk4Q8VEJ3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms