Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fam20bQ8VCS3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam20bQ8VCS3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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