Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms