Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrit1Q8K099 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrit1Q8K099 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms