Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcl3Q8BVF2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdcl3Q8BVF2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdcl3Q8BVF2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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