Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm29Q6PDI5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ecm29Q6PDI5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm29Q6PDI5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms