Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NipblQ6KCD5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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