Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Knl1Q66JQ7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms