Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb6Q60692 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms