Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SynrgQ5SV85 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynrgQ5SV85 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms