Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spsb3Q571F5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms