Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930567H17RikQ3V0K5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930567H17RikQ3V0K5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms