Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C87499Q3UX49 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C87499Q3UX49 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C87499Q3UX49 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms