Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rmdn3Q3UJU9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rmdn3Q3UJU9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rmdn3Q3UJU9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rmdn3Q3UJU9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rmdn3Q3UJU9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rmdn3Q3UJU9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rmdn3Q3UJU9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rmdn3Q3UJU9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms