Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd11Q1RNF8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd11Q1RNF8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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