Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ptchd1Q14B62 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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