Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn6Q03958 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn6Q03958 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms