Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2mP61082 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2mP61082 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2mP61082 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms