Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb41P48193 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb41P48193 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb41P48193 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms