Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nedd4P46935 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nedd4P46935 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nedd4P46935 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms