Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms