Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnga1P29974 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cnga1P29974 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms