Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb9P28076 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms