Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtmaP26350 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtmaP26350 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtmaP26350 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtmaP26350 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtmaP26350 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtmaP26350 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtmaP26350 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtmaP26350 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PtmaP26350 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtmaP26350 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms