Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna3P16390 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcna3P16390 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcna3P16390 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms