Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RhoP15409 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RhoP15409 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RhoP15409 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RhoP15409 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RhoP15409 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RhoP15409 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RhoP15409 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RhoP15409 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RhoP15409 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RhoP15409 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RhoP15409 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RhoP15409 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RhoP15409 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RhoP15409 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RhoP15409 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RhoP15409 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RhoP15409 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RhoP15409 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RhoP15409 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RhoP15409 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RhoP15409 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RhoP15409 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RhoP15409 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RhoP15409 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RhoP15409 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RhoP15409 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RhoP15409 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RhoP15409 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RhoP15409 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RhoP15409 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RhoP15409 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RhoP15409 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RhoP15409 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RhoP15409 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RhoP15409 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RhoP15409 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RhoP15409 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RhoP15409 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RhoP15409 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RhoP15409 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RhoP15409 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RhoP15409 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RhoP15409 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RhoP15409 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RhoP15409 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RhoP15409 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RhoP15409 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RhoP15409 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RhoP15409 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RhoP15409 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RhoP15409 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RhoP15409 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RhoP15409 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RhoP15409 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RhoP15409 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RhoP15409 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RhoP15409 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RhoP15409 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RhoP15409 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RhoP15409 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RhoP15409 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RhoP15409 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RhoP15409 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RhoP15409 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RhoP15409 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RhoP15409 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RhoP15409 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RhoP15409 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RhoP15409 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RhoP15409 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RhoP15409 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RhoP15409 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RhoP15409 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RhoP15409 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RhoP15409 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RhoP15409 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RhoP15409 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RhoP15409 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RhoP15409 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RhoP15409 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RhoP15409 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RhoP15409 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RhoP15409 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RhoP15409 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RhoP15409 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RhoP15409 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RhoP15409 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RhoP15409 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RhoP15409 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RhoP15409 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RhoP15409 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RhoP15409 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RhoP15409 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RhoP15409 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RhoP15409 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RhoP15409 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RhoP15409 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RhoP15409 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RhoP15409 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms