Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lamc1P02468 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lamc1P02468 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lamc1P02468 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lamc1P02468 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lamc1P02468 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lamc1P02468 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lamc1P02468 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lamc1P02468 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lamc1P02468 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lamc1P02468 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms