Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01725 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01725 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01725 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01725 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01725 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01725 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01725 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01725 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01725 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01725 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01725 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01725 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01725 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01725 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01725 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01725 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01725 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01725 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01725 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01725 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01725 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01725 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01725 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01725 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01725 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01725 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01725 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01725 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01725 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01725 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01725 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01725 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01725 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01725 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01725 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01725 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01725 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01725 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01725 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01725 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01725 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01725 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01725 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01725 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01725 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01725 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01725 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01725 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01725 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01725 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01725 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01725 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01725 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01725 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01725 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01725 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01725 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01725 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms