Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rabep1O35551 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rabep1O35551 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rabep1O35551 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms