Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf5O35445 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms