Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8356J3QPD3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8356J3QPD3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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