Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20828J3KMI7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms