Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8247F6VRJ8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8247F6VRJ8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms