Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh3b2E9Q3E1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b2E9Q3E1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b2E9Q3E1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b2E9Q3E1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b2E9Q3E1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b2E9Q3E1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh3b2E9Q3E1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b2E9Q3E1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b2E9Q3E1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b2E9Q3E1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b2E9Q3E1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh3b2E9Q3E1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms