Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trappc8E9PWG2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trappc8E9PWG2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms