Protein–RNA interactions for Protein: E9PVI0

Vmn2r34, Vomeronasal 2, receptor 34, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r34E9PVI0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn2r34E9PVI0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Vmn2r34E9PVI0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Vmn2r34E9PVI0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r34E9PVI0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms