Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt2E9PUL5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt2E9PUL5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms