Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp42B2RQC2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp42B2RQC2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp42B2RQC2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp42B2RQC2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp42B2RQC2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 269.9 ms