Protein–RNA interactions for Protein: A2ARC0

Gm13547, Predicted gene 13547, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13547A2ARC0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm13547A2ARC0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm13547A2ARC0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm13547A2ARC0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm13547A2ARC0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm13547A2ARC0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm13547A2ARC0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm13547A2ARC0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm13547A2ARC0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm13547A2ARC0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm13547A2ARC0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms