Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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