Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
1700019A02RikA0A087WPV9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700019A02RikA0A087WPV9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms