Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nup160Q9Z0W3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nup160Q9Z0W3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.6 ms