Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Six6Q9QZ28 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Six6Q9QZ28 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms