Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VapbQ9QY76 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms