Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Plxnb3Q9QY40 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms