Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Edf1Q9JMG1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Edf1Q9JMG1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Edf1Q9JMG1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Edf1Q9JMG1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Edf1Q9JMG1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Edf1Q9JMG1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Edf1Q9JMG1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Edf1Q9JMG1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Edf1Q9JMG1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Edf1Q9JMG1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Edf1Q9JMG1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Edf1Q9JMG1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms