Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col5a3Q9JLI2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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