Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3glb1Q9JK48 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms