Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Herpud1Q9JJK5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herpud1Q9JJK5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms