Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn19Q9ET38 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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